緑島は亜熱帯気候で、年中温暖、雨量が多いです。雨季は11月から翌年３月にかけての期間。7〜10月下旬には夕立や台風がよくあり、雨量が最も多い季節です。なお、緑島は風がよく吹きます。１０月からは東北季節風が吹き始め、強い風が海で霧を生成し、地元の人からは「塩っぱい雨」と呼ばれています。